认定高新技术企业时，总收入包括销售研发废料收入吗?
公司销售研发废料，按未开票收入申报缴纳增值税，并冲减研发费用。请问在认定高新技术企业时,计算“高新技术产品(服务)收入占比是指高新技术产品(服务)收入与同期总收入的比值”，这项销售废料收入含在总收入里面吗?在计算高新企业研发费用占比时，是按照冲减前的研发费用计算还是冲减后的呢?
解答：
下面分别予以回答。
一、两个的问题完整结论+政策依据
问题1：销售研发废料收入是否计入高企认定“总收入”（高新收入占比分母）
结论：需要计入总收入
1.政策依据
《高新技术企业认定管理工作指引》（国科发火〔2016〕195号）第三条第（四）项：
总收入=企业所得税法第六条规定的收入总额−不征税收入。
《企业所得税法》第六条：收入总额包含销售货物收入、其他收入；研发废料变卖属于销售货物/其他应税收入，无任何剔除条款。
2.实务说明
废料未开票收入已申报增值税，属于税法应税收入，全额并入收入总额，抬高总收入分母、稀释高新产品收入占比，存在不满足60%硬性指标风险。
问题2：高企研发费用占比计算，按冲减前还是冲减后研发费用？
结论：高企认定研发费用基数取冲减前实际投入总额；仅研发费用加计扣除才按冲减后金额计算
1.政策区分（双口径差异）
（1）高新技术企业认定口径（国科发火〔2016〕195号）
文件仅规定研发费用归集范围，未要求用废料收入冲减研发投入；高企审核核心核查企业真实研发投入规模，不以废料处置收入扣减投入基数，全国主流认定、专项审计统一执行该口径。
企业会计账面冲减研发费用仅为账务处理，出具高新专项审计报告、计算研发费用占销售收入比例时，还原为材料投入原值（冲减前金额）。
（2）研发费用加计扣除口径（国家税务总局公告2017年第40号第七条）
研发下脚料、残次品、废料处置收入，必须在当年扣减可加计扣除研发费用，不足扣减的加计基数按0计算；该规则仅适用于企业所得税汇算加计扣除，不适用于高企认定。
2.实务佐证
天津、浙江、河南等多地税务、注协、科技部门统一口径：会计冲减仅影响加计扣除，高企研发投入按实际领料、实际发生全额统计，不扣废料收入。
二、分场景政策依据汇总
（一）总收入判定依据
1.《科技部财政部国家税务总局关于修订印发〈高新技术企业认定管理工作指引〉的通知》（国科发火〔2016〕195号）第三条（四）；
2.《中华人民共和国企业所得税法》第六条、《企业所得税法实施条例》第十六条。
（二）高企研发费用口径依据
国科发火〔2016〕195号第三条（六）研发费用归集范围，无废料收入冲减条款。
（三）加计扣除冲减规则依据
《国家税务总局关于研发费用税前加计扣除归集范围有关问题的公告》（国家税务总局公告2017年第40号）第七条第（二）项。
三、实操风险提示
1.废料收入计入总收入，会降低高新产品收入占比，若原本刚好达标60%，可能直接不满足高企认定条件；
2.账务建议：研发废料收入单独台账备查，高新专项审计时向会计师提供废料销售明细、领料单，证明研发投入真实完整；
3.两套台账分离：
（1）高新申报：研发费用=冲减前全部投入；
（2）所得税汇算加计扣除：研发费用=冲减前投入−当年废料处置收入。
